우리나라 노동시장에서 나타나는 특징 중 하나는 여성 경제활동참가율의 증가이다. 그러나 고용형태에 따른 계층화, 이원화 등으로 인해 근로소득격차가 확대되고 있어 여성집단 내 불평등이 심화되고 있다. 본 연구는 이변량프로빗모형을 이용하여 여성의 취업여부와 임금근로･자영업선택의 결정요인을 분석하고, 나아가 OLS 추정과 분위회귀모형을 이용하여 고용형태별 근로소득 격차의 크기와 요인을 분석한 후 정책적 함의를 논의하고 있다. 실증분석에는 한국노동패널 15차 자료가 사용되었다. 주요 분석 결과를 보면 첫째, 자영업집단은 임금근로집단보다 소득편차가 크고, 부문내 이질성이 큰 것으로 나타났다. 둘째, 자영업여성의 소득이 임금근로여성보다 높으며, 소득분위가 높아질수록 자영업자와 임금근로자간의 소득격차가 확대된다. 셋째, 소득 10분위와 90분위를 제외한 모든 소득분위에서 6세 미만 자녀와 6세 이상~18세 미만 자녀가 있을수록 시간당 임금이 낮아지는 것으로 분석되었다. 이러한 분석결과는 여성이 속한 가구의 경제적 특성, 그리고 자녀양육으로 인한 여성의 노동시장 불평등과 여성 간 불평등 완화를 위한 적극적인 사회적 보호대책이 필요함을 말해준다. 구체적 대안으로서 임금근로뿐 아니라 영세자영업에 대한 정책적 배려가 필요하며, 특히 산업 및 직업별, 사업규모별로 특화된 접근이 필요하다. 또한 공보육의 양적인 확충과 더불어 질적 제고와 여성의 경력단절을 예방할 수 있는 보육 및 돌봄 서비스의 확충 등이 마련될 필요가 있다. In spite of the fact that the female workforce is one of the keys to future national competitiveness, women have been suffering from many different kinds of discrimination in recruitment, stratification, separation, and compensation in the labour market. This study is analysing the factors determining selecting self-employment or paid-employment and compares the self-employment and paid-employment sectors in terms of inter among female earnings differentials and their sources. Data used for this study are fifth waves of Korean Labor and Income Panel Study(KLIPS). Analysis models include Probit model to women's labor participation selection(employment or unemployment/ self-employment or paid-employment) and Quantile regression method to examine the effects of earnings gap. The results indicates that first, human capital such as educational attainment and age has positive effects on female's selection of self-employment. Second, human capital, socio-demographic features, and labor market factors are significantly increased the earned income of the paid-employed. The analysis also revealed that the children of the self-employed could be significantly affected by other factors including family income, employees. With these results, the author suggests universal family and labor policies to support women’s labor participation and the reconciliation of work and family.