본 연구의 목적은 지방의료원의 경영개선에 대한 압력이 강한 가운데 지역 내 환경적 변수가 공익성과 수익성의 개선이라는 성과에 미치는 영향을 분석하는 것이다. 2007~2009년 사이에 공공거점병원인 34개 지방의료원의 투입물과 산출물을 이용하여 윈도우 기법을 활용한 자료포락분석(Data Envelopment Analysis)을 하였다. 토빗(Tobit) 회귀분석을 이용하여 관내 환경요인까지 포괄한 모형의 효율성 점수와 환경요인을 고려하지 않은 효율성의 점수 간 차이를 비교하고 효율성 개선정도에 대한 군집분석을 하였다. 연구결과는 각 의료원별로 두 점수 간의 차이가 큰 가운데 부정적인 환경적 여건에도 17개 지방의료원의 공익성과 수익성 모두에서 성과가 개선된 것으로 나타났다. 반면 기존의 효율성 분석결과와는 다르게 민간위탁 된 병원들은 수익성의 향상에는 긍정적이지만 공익성은 개선하지는 못하였다. 그러므로 관내 환경적 요인을 고려하고 공익성을 강조하도록 지방의료원에 대한 성과평가체계를 다시 구상할 필요가 있다.